太平天國運動是中國封建王朝歷史上最後一次大規模的農民起義，這次農民起義可以說是涵蓋了古代農民起義元素的集大成者。中國古代歷史上中國的農民起義要麼藉助於宗教、要麼藉助於天災，要麼藉助於外來侵略。而洪秀全從傳教開始就致力於用宗教對滿清貴族進行妖魔化。清朝皇室和滿清貴族一直是洪秀全致力於打擊的首要物件，尤其是清朝開國貢獻最大的八旗軍隊。

在南方為主戰場的形勢下，清朝在南京留守包括從北方調來的八旗軍和綠營軍被殲滅大部且損失慘重。滿族將帥紛紛上陣，都遭受失敗或者被擊斃，或者被罷黷。比較有名的有賽尚阿、達洪阿、巴清德、祥厚、和春、烏蘭泰、德興阿等人，捻軍聯絡的太平天國軍隊甚至把僧格林沁挑於馬下。

因為國防的崩潰並且常備軍隊無力承擔對內鎮壓的任務，同治等皇帝不情願地任用漢族地主武裝：湘軍、淮軍。中興四大名臣胡林翼、左宗棠、曾國藩、李鴻章這些地方實力派趁勢崛起。

這些地方實力派人物首先在地方奪取軍事和行政權力，控制總督、巡撫等要職，逐漸排擠滿族一派的權貴。不過這一過程並不順利，且伴隨著與太平天國拉鋸戰的局面中。其中出現過曾國藩跳水和左宗棠要被逮捕入京的局面，不過最終化險為夷。在獲取地方權力並形成龐大複雜的利益網之後，逐步向中樞權力進行滲透和擴張。

據統計1865年-1866年清朝23個督撫的職位中就有湘軍和淮軍集團的17個人。其次太平天國起義打破了清朝軍為國有的兵制局面，形成了兵為將有的格局，這一格局一直持續到民國，並形成了軍閥等惡劣後果。

從控制軍隊入手，進而藉助著洋務運動的機會，掌握和興建軍工業並獲取海軍裝備和財政。這一局面尤其是李鴻章的淮軍佔據最多。經濟上湘軍和淮軍進行大肆侵吞太平天國庫藏，濫收稅金、掠奪土地，形成軍隊統帥私自佔有的惡習。比如李鴻章在老家廬江合肥就有50萬畝土地，並且其弟弟連戰國時代的青銅器都能收藏。

李鴻章開辦了輪船招商局、開平礦務局、上海機器織布局、電報總局等企業，形成了最初的官僚資本。湘軍和淮軍兩大集團本來就同根同脈，在同治年間就形成了可以與中央隱然抗衡的實力，並能影響和牽制中央的決策，從而改變清朝後期的政治格局。

虛幻的同治中興局面使得清朝開國造就的滿漢官僚權力分配格局被打破。康熙在削平三藩形成的內重外輕的中央集權被太平天國起義嚴重的衝擊。外國列強為了滲透和擴大在華利益，自然也相中了地方實力派作為代理人。

督撫專政的政治隱患就此埋下，在慈禧時代尚能夠控御形成統一局面，但是到了宣統時代攝政王載灃掌控的已經不是傳統士大夫那套君叫臣死價值觀的袁世凱了。滿族權貴無論是武力和政治智慧已經無法駕馭地方實力派。最終地方實力派與革命派妥協聯手將滿清推翻。

最終洪秀全、四大名臣、皇族在面對三千年未有之大變局的局面，紛紛登場最後只是成為滾滾時代大潮下的棋子。虛幻的同治中興既沒有挽救皇族 ，也沒有挽救國運。這一歷史任務直到60年一甲子的輪迴才 被打破。