秦孝王用商鞅變法，一切都按商鞅的想法，在秦國執行政治，軍事，縣制，其它改革。極大損害舊貴族世襲權力和利益。遭到他們強烈反對。但也使商鞅變法成功中名聲大振。又在戰爭中爭得功勳，遠遠超過太子。而且太子在商鞅變法時和秦國舊貴族也一起反對。商鞅開始變法執行時，使變法在國內行不通。商鞅對秦孝公說，變法在國內行不通，這主要是秦國舊貴族的干擾，對太子不能用墨刑。可以對他的老師執行墨刑。這使太子顏面無存，威風掃地，懷恨在心。

從當時戰國的大環境來分析，商鞅之死只是比其他變法者更加慘一點而已，但本質是一樣的。當時的七國盛行變法，以便獲得更多的人口和賦稅，使國家更加強大，但國家的真正大股東是以國君為首的宗室，然後是小股東國家貴族集團。但變法往往會傷害到既得利益者-國家貴族集團甚至於宗室都有可能-，這樣既得利益者就會不滿，這些人是有話語權的，所以衝突是必然的。

商鞅變法的確有利於國家。但是興一利也生一弊，變法自然也不是、更不可能是無懈可過，一點缺陷都沒有的！那麼既然有弊病，那就自然會失害到某些人的利益，也因此會招來怨恨——甚至是那些正在享受變法帶來的成功果實的人，他們也是恨商鞅的。所以當秦孝公這位商鞅的堅定支持者死了以後，商鞅就陷於孤立無助的危境之中了！

況且商鞅太過急功近利，秦孝公給了商鞅很大的權力，而商鞅也開始大刀闊斧地改革，商鞅加大了刑法的力度，並且很多改革都是強制進行的。這讓很多老百姓在享受新法便利的同時也懼怕著新法，這樣下去，老百姓遲早也會受不了新法。所以說，商鞅的悲劇結局也有自取滅亡的成分。