1620 年夏天，開普勒將林茨家裡的所有東西都打包收拾好，臨行前，他讓助理格林加萊用油畫幫他畫一幅自畫像。畫完後就立刻送到他最信任的朋友馬蒂亞斯·貝爾納格那裡。馬蒂亞斯在斯特拉斯堡傳播政治思潮，以激發新一輪的政治改革，他還鼓勵開普勒寫自傳。開普勒匆忙給這位朋友寫了一張紙條，說那幅自畫像在今後將有很大用處，但是目前確實沒有時間寫自傳。 在今天看來，我們僅僅從這幅畫中知道五十歲的開普勒長什麼樣，他那時候正忙於自己母親審判的最後階段，即將穿過那片被戰爭、疾病和貧困蹂躪的土地。這是開普勒成年後唯一一幅清晰的肖像畫，另一幅肖像被刻在 1627 年出版的《魯道夫星表》中粗糙的卷首插畫上，這幅插畫暗示了一個筋疲力盡、入不敷出且長時間在燭光下為國王工作的天文學家，他穿著肥大的睡袍，頭戴一頂睡帽。

這幅自畫像則展示了一個充滿自信的開普勒，黑頭髮、精心修理的鬍鬚和炯炯有神的黑眼睛。開普勒曾說過，自己的科研工作非常艱辛，所以在寫作時會用輕快的文筆去掩蓋，讓讀者覺得他是一個積極向上的人。從林茨這幅自畫像中可以看到開普勒精心打扮了一番，好像要接受最高榮譽一樣。事實上，詩人兼牧師約翰·多恩曾在 1619 年拜訪過開普勒，並把他當作以唐卡斯特子爵為首的龐大外交使團的一員。使團受詹姆斯一世委託，目的是結束波希米亞戰爭。開普勒本人也非常努力地去爭取和平。亨利·沃頓爵士是詹姆斯一世的外交官，甚至在近期還到林茨和開普勒見過面。他熱情地給年老的弗朗西斯·培根寫信，向其介紹開普勒發明的精巧的機器——一臺能夠更精準地測量土地面積的機器。開普勒在給爵士介紹自己的機器時面帶笑容，詳細說明了如何用它去更好地測量君主的領土，並且更合理地收稅。

自畫像中的開普勒和真人一模一樣，在介紹自己最新研究成果時表現得自信滿滿。他身穿緊身黑色天鵝絨長袍，脖子上圍一圈白色飛邊，袖口用精美的蕾絲點綴，金色腰帶的正中是一顆珍貴的紅寶石。這位皇家數學家右手插在腰間，全身上下散發出一股與眾不同、機敏迷人的特質。如果開普勒或多或少認為時間奪去了母親的容貌，那麼這張圖中的男人則正值事業的巔峰。由於他的助手不是職業畫手，所以開普勒不得不擺了幾個小時的姿勢。

這幾個小時站得也很值，因為這幅畫把開普勒描繪得惟妙惟肖，他身上的每一個細節——他的相貌、活力、姿態、服飾、髮型和飾品——都能在這幅畫中體現出來。幾何學認為，比例均衡就是美。開普勒本人也認為外貌非常重要，所以在前往萊昂貝格時要盛裝打扮一番。上層人士總是透過相貌和穿著去辨別誰正在追求更好的職位，追求的動力是來自競爭、私利、虔誠還是為了服務大眾。沃頓公爵本人特別善於觀察，就拿他對利奧波德大公的評價來說：此人身材勻稱、面板白皙、面容姣好，算得上整個哈布斯堡王朝最英俊的男人。他從不裝模作樣，但也沒有豐富的面部表情，他的長相遠比其穿著更吸引人。1620年 10 月，據說開普勒已經接受了沃頓的邀請，準備為英王效力。

朋友貝爾納格花錢僱傭佛蘭德藝術家雅各布·範德海登把開普勒的自畫像刻了下來，但該作品質量奇差，成了朋友們的笑柄，這讓開普勒非常惱怒。開普勒在這個雕刻作品中眼神遊離、神情悲傷、面露稚嫩、似乎陷入了沉思之中。開普勒未能進入大學任教進一步說明了他不適應已有的基督教規範。 就在 1619 年夏天，符騰堡教堂理事會重申，除非開普勒真正從內心信仰路德宗，否則永遠都不能享用聖餐。哈芬雷費爾是開普勒在圖賓根上學時候的老師，以前一直是他的支持者。他在最後一次和開普勒通訊時譴責他飽受「困惑的靈魂」之害，勸其放棄理性，重拾對上帝的信仰。他認為理智矇蔽了開普勒的雙眼。德高望重的神學家威脅說，如果開普勒仍然固執己見，那麼他的靈魂也終將墮落。到那時候，也許就會受到魔鬼的攻擊。

儘管開普勒努力在公眾面前把自己標榜為一個有教養、有理智的人，但在 1621 年 4 月，他又一次被母親的刑事審判激怒，不得不努力壓制自己的怒火。因為圖賓根大學的法學教授們將最終決定是否對卡塔琳娜用刑，所以開普勒深知自己必須向他們解釋清楚，是一個無能的政府讓自己的家庭成了犧牲品。他準備公開抗議政府的行為。