中國的這位神醫的高超醫術絕大多數是從印度神話故事中抄襲而來的，而在中國歷史中從來沒有發生過。陳寅恪還說華佗的原型是印度神醫耆域。因為所記載的華佗治病的故事都與印度神醫耆域治病故事雷同。如《三國志》記載，華佗治病時，會先讓必須動手術的病人服下麻沸散，然後再破腹取出患結。病患如果是在腸子裡，就切開腸子進行清洗，再把腹部縫合，在傷口敷上藥膏，四五天後傷口便痊癒了，不再疼痛，病人自己也沒有感覺，一個月左右，傷口就會完全長好。

這個故事其實來自於耆域治拘閃彌長者兒子的病。而且中國的古籍上並沒有關於麻沸散的記錄。最早的記錄也只是宋朝才出現的“曼陀羅花”，不過只能止住微痛，像做手術這樣的疼痛曼陀羅花是起不了任何作用的。事實上，全身麻醉手術都必須用吸入或靜脈注射麻醉藥，不能口服。而且做手術的醫生需要懂得解剖學的知識，在華佗的時代中國人根本不可能會知道這些。

後世所傳的“華佗畫像”和“華佗廟”也並無史料記載，有人推測“華佗畫像”是後人憑著想象所畫出來的。而替關公刮骨療傷和建議曹操用斧頭砍開腦袋治療頭風病以及最後被殺都是小說家杜撰出來的。

不過也有人反對以上觀點，認為在許多歷史書籍中對於華佗的記錄很多，不可能人人都是編造出來的吧？而且就算和印度神話有相同之處，也不能說明中國古時真的就沒有華佗的存在。而且陳寅恪把華佗的名字與印度教的名字扯在一起本來就有些牽強，因為中國有很多名字是從印度語中演變過來的，怎麼就能下定論說華佗只是中國的一個神話？看來歷史上究竟有沒有神醫華佗還有待學者的進一步研究。但是無法改變的事實是，華佗已經成為中國醫學的“醫神”了。