但那時沒有人知道，因為這次重建讓一個埋藏千年的秘密，重現人間。在1987年4月3日，考古人員無意間發現了一塊白玉板，在推開白板周圍的碎石板後出現了一個洞口，至此法門寺地宮面世。法門寺據傳始建於公元68年，約有一千七百多年的歷史，素來有“關中塔廟始祖”之稱，在周魏以前被稱作“阿育王寺”。

隋文帝時改稱為“成實道場”，唐高祖時改名為“法門寺”，他被譽為皇家佛寺，而歷史悠久的法門寺地宮更是被譽為世界第九大奇蹟。它是一部追溯歷史文化的佛教“史記”，也是在現佛教聖地的一幅歷史畫卷。在地宮中發現的佛指舍利是世界上迄今為止發現的獨一無二的，兼有文獻記載和碑文證實的釋迦牟尼佛真身舍利，是佛教世界最高的聖物，它也是我國現存的唯一佛指舍利。

而在這座目前為止發現的年代最久遠、規模最大、等級最高的地宮中更是有大量珍貴文物出土，在法門寺地宮中藏有世界上最早的同時絕無僅有的玳瑁幣。玳瑁屬於海龜科，背甲可以製作成精美飾品，在地宮出土的兩萬七千多枚錢幣中，有13枚從來沒有史籍上見過的貨幣，玳瑁製成的“開元通寶”。

在地宮之中，還發現了目前已知年代最早，體型最大，等級最高，製作最精美的佛教法器，一枚雙輪十二環金花銀錫杖，它被譽為“錫杖之王”，堪稱稀世珍寶。還有七百多件絲織品，幾乎包含了唐代所有的絲綢品種和絲織工藝，堪稱唐代絲綢博物館，還有一套完整的唐代宮廷茶具等古代珍品文物。

法門寺地宮打開了埋藏了一千多年的佛教和盛唐王朝寶藏，如今重建後的它被譽為“護國真身寶塔”是為世界寺廟之最，吸引著世界各地的人前來朝聖瞻仰其風采。