滿洲八旗的旗主都由愛新覺羅氏掌握。具體來說，就是由努爾哈赤和其弟舒爾哈齊的後裔來掌控。有些人特意強調，八旗分為滿蒙漢，總計二十四旗。但蒙八旗和漢八旗是沒有獨立旗主的，蒙漢八旗也歸滿旗旗主進行統領。

八旗的由來

最早的八旗制度，沒有後來那麼複雜，只有旗主和佐領兩級。並且也沒有八個旗，只有一個旗。

努爾哈赤起兵後，先建立了一旗部隊，旗色不清楚，有可能是黑色旗。

後來他消滅了鄰近的一大批部落，組成一支新旗，旗色也不太清楚，可能是紅色旗。

於是，努爾哈赤就將自己原有的黑旗交給了親弟弟舒爾哈齊，然後他自己統帥新建紅旗。後來改紅旗為黃旗。

萬曆二十九年（公元1601年），努爾哈赤征服了海西女真四部之一的哈達部。他把哈達部的人丁編為一個旗，讓自己的長子褚英和哈達部的首領吳爾古代（哈達納拉氏）共同管理。這個哈達部的旗，旗色為白色。這便是正白旗的由來。

不久後，褚英廢除吳爾古代的首領地位，他自己獨自成為旗主。同時，舒爾哈齊的正藍旗得到了進一步擴充，這些藍旗新歸附的人丁，被封給了太祖的次子代善。所以這一時期，代善是正藍旗裡的“小旗主”。

萬曆三十七年（公元1609年），正藍旗旗主舒爾哈齊被努爾哈赤幽禁。在正藍旗中，原屬於舒爾哈齊的佐領，一多半被舒爾哈齊的次子阿敏繼承。

剩下的原屬舒爾哈齊，但沒有劃歸給阿敏的佐領，則劃歸到了代善的名下。

代善之前在正藍旗中的原班人馬，加上新劃給他的人馬，一起脫離出正藍旗，獨立為一個新旗，旗色為紅旗。後來屹立二十多年不倒的正紅旗也就是這麼來的。

萬曆四十二年（公元1611年），努爾哈赤將自己的長子、正白旗的旗主褚英幽禁。正白旗大部分佐領被封給了皇太極。而剩下的一部分佐領，被褚英的長子杜度繼承。於是皇太極就成了正白旗的旗主，而杜度則是正白旗的“小旗主”。

萬曆四十三年（公元1615年），努爾哈赤下令將四旗擴充為八旗。他自己的黃旗分為正黃、鑲黃兩旗，均由他親自統領。

代善的紅旗，也分成正紅、鑲紅兩旗，由代善和代善的兒子們統領（代善的兒子嶽託和碩託均是鑲紅旗的小旗主）。

原藍旗的旗主阿敏，成為鑲藍旗旗主，屬人沒有變化。

正藍旗的旗主則由努爾哈赤的第五子莽古爾泰擔任。另外，莽古爾泰的親弟弟德格類擔任小旗主。

正白旗旗主不變，仍由皇太極擔任。

鑲白旗旗主由原正白旗小旗主杜度擔任，同時努爾哈赤把自己的第七子阿巴泰也塞進了鑲白旗，與杜度共同組成了鑲白旗（阿巴泰是小旗主）。

這裡額外插一句，當時的八旗的旗子，應該是沒有圖案的，也就是一面只有顏色的旗幟。四鑲旗是在旗子中間加一條龍。我們今天看到的這種八旗旗子的樣式，是公元1622年之後才確定的樣式。

後金天命八年（公元1623年），努爾哈赤按照女真人“嫡長子繼承皇位，嫡幼子繼承財產”的傳統。將自己的三個嫡幼子：18歲的阿濟格、11歲的多爾袞、9歲的多鐸，納入自己親自統領的兩黃旗，並將兩黃旗拆分，分別封給他們，使他們成為小旗主。

當時努爾哈赤的兩黃旗一共有60個佐領，他把正黃旗的15個佐領封給阿濟格，另外15個佐領封給多爾袞。再從鑲黃旗分出15個佐領封給幼子多鐸，剩下的15個鑲黃旗佐領由他親自統領。

然後努爾哈赤立下遺囑，等他去世後，他自己統領的15個鑲黃旗佐領，也交給多鐸繼承。相當於就是說，阿濟格為正黃旗旗主，多鐸為鑲黃旗旗主；多爾袞沒有位置，於是努爾哈赤把鑲白旗旗主杜度調到鑲紅旗，好讓多爾袞繼承鑲白旗。

結果這次調動還沒有完成，努爾哈赤就突然死了。皇太極瞅準機會，迅速讓兒子豪格搶佔了沒有旗主的鑲白旗。這一下，皇太極父子就搶到了兩白旗。

這裡額外插一句，這次分封后，由於正黃旗分給了阿濟格和多爾袞，鑲黃旗成了努爾哈赤唯一親領的旗。因此鑲黃旗就變成了八旗的頭旗。很多人經常問，八旗之首是哪個旗？看到這裡應該就知道了——是鑲黃旗。

皇太極時期的八旗變動

努爾哈赤死後，皇太極繼位。這位新任大汗是個狠角色，為了打壓不服他的人，皇太極對八旗進行了三次大的調整。

第一次調整——兩黃旗和兩白旗互換。

這次調旗很簡單，就是皇太極的正白旗、豪格的鑲白旗和阿濟格、多爾袞、多鐸的兩黃旗對調。因為皇太極是後金大汗，他認為黃旗只有大汗才配使用。所以，繼承了汗位的皇太極就逼著多爾袞三兄弟與自己對調了旗色，以彰顯自己的“正統性”。

需要說明的是，這次調整隻換旗色，也就是兩白旗換兩黃旗，服裝顏色對調；兩黃旗換兩白旗，服裝顏色對調。而旗主之下的附屬人員沒有進行變動。

第二次調整——鑲藍旗旗主換人。

永平之戰後，阿敏（舒爾哈齊的次子）逃回關外，皇太極藉此機會整肅阿敏。他召集眾大臣及貝勒，給阿敏定了議十六項大罪。最後處理結果是：削去阿敏的旗主之位，並將其圈禁在家。其所屬鑲藍旗則賞給跟皇太極穿一條褲子的堂弟濟爾哈朗。

由於濟爾哈朗也是舒爾哈齊的兒子，這次換旗主，鑲藍旗沒什麼異動。

第三次調整——兩黃旗和正藍旗的混編。

後金天聰六年（公元1632年），正藍旗的旗主莽古爾泰病逝，正藍旗的旗主由原先正藍旗小旗主莽德格類繼承，而莽古爾泰的佐領也由莽古爾泰的兒子繼承（小旗主）。

後金天聰九年（公元1635年），正藍旗的旗主德格類病死，同年有人告發莽古爾泰、德格類一門謀反。皇太極趁此機會將莽古爾泰和德格類一門剝奪旗權，順便將正藍旗沒收為己。於是正藍旗就被皇太極給吞併了。

吞併正藍旗後，皇太極將原正藍旗的八個佐領封給兒子豪格，又拿出三個封給鑲黃旗小旗主阿巴泰，加強了原鑲黃旗的實力。同時也削弱了正藍旗的凝聚力。

沒過多久，皇太極將正黃旗的一半與正藍旗的一半進行捏合，組成新的正黃旗。將正黃旗和正藍旗剩下的一半捏合，組成新的鑲黃旗，都由皇太極親自統領。

鑲黃旗歸皇太極後，原鑲黃旗旗主豪格帶著自己的佐領改為正藍旗，成為正藍旗的旗主。原鑲黃旗的小旗主阿巴泰，也同樣成為了新正藍旗的小旗主。

這次調整之後，八旗旗主如下：

兩黃旗——皇太極；

正藍旗——豪格，阿巴泰（小旗主）；

鑲藍旗——濟爾哈朗；

以上四旗是皇太極的嫡系人馬

正紅旗——代善；

鑲紅旗——嶽託，碩託（小旗主）；

兩紅旗在代善的統領下，保持中立。

正白旗——多鐸；

鑲白旗——阿濟格，多爾袞；

兩白旗與皇太極暗中較勁

多爾袞時期的八旗變動

皇太極死後，多爾袞掌權。他和皇太極是一丘之貉，掌權之後也是大肆吞併其它旗。具體的調整有兩次。

第一次調整——兩白旗混編。

大清崇德八年（公元1643年）八月，皇太極突然去世。他去世之後兩個月。多爾袞仗著自己有權有勢，趁機沒收了親弟弟多鐸在正白旗的15個佐領。

多爾袞手上本身就有15個佐領，沒收多鐸的15個佐領後，多爾袞就具有了30個佐領，即一個整旗的實力。

之後多爾袞的將自己所領鑲白旗的與多鐸的正白旗進行對調，自己成為正白旗旗主，而原屬正白旗的多鐸，則換色為鑲白。

本身就在原鑲白旗的阿濟格並沒有參與此次換旗。多鐸換到鑲白旗後，他是旗主，阿濟格變成了鑲白旗的小旗主。

第二次調整——兩白旗與正藍旗混編。

爭儲事件後，多爾袞和豪格結了樑子。為了搞死豪格，多爾袞下了大力氣。大清順治五年二月（公元1648年），多爾袞將豪格打下大獄，沒收了他的正藍旗。（還搶了豪格的小老婆）

豪格的正藍旗被沒收後，多爾袞沒有上交給順治皇帝，而是被他以“俟歸政，然後隸於上”的名義私吞了。

順治六年（公元1649年），鑲白旗旗主多鐸病逝。多爾袞便將兩白旗和正藍旗一起混編。原本屬於豪格的正藍旗佐領和原本屬於多鐸、阿濟格的鑲白旗佐領對調。

對調之後，新的鑲白旗沒有旗主，多爾袞當仁不讓的自領鑲白旗旗主，加上正白旗，他就成為了兩白旗的旗主。

而新的正藍旗則由原鑲白旗的阿濟格、多鐸的次子多尼、阿巴泰第三子博洛、阿巴泰第四子嶽東四人共同管理。這四個人中，多尼名下的佐領數量最多，所以他是旗主，另外三人是小旗主。

另外，正紅旗旗主代善於同年病死。他的兒子鑲紅旗旗主碩託在三年前被處死（嶽託死後碩託繼任）。因此兩紅旗的旗主也都換了人。正紅旗旗主為滿達海（代善兒子）、鑲紅旗旗主為羅科鐸（嶽託孫子）。

這一系列震動之後，八旗旗主如下：

兩黃旗——順治帝；

兩白旗——多爾袞；

正紅旗——滿達海，勒克德渾（小旗主）；

鑲紅旗——羅科鐸，尼堪、碩塞（小旗主）；

正藍旗——多尼，阿濟格等人（小旗主）；

鑲藍旗——濟爾哈朗；

八旗旗主的最終確定

經過努爾哈赤、皇太極、多爾袞歷經二十幾年的調整，此時的八旗已經面目全非，跟最早的時候，完全不是一回事了。

比如正白旗旗主原本是褚英，結果褚英被努爾哈赤弄死，正白旗的人馬交給了皇太極和褚英的兒子杜度繼承。到了八旗建立時，杜度調任鑲白旗，褚英當年的人馬就變成了鑲白旗。後來努爾哈赤為了給多爾袞挪位，把杜度挪到了鑲紅旗，褚英一系的人馬又調到了鑲紅旗。這變來變去的，八旗早已經不是當年的八旗了。

多爾袞死後，順治皇帝秋後算賬，又對八旗做了一次大的調動。

第一步，他先是把多爾袞的兩白旗沒收。正白旗整旗被順治皇帝收走，同順治親自掌控的兩黃旗一起變成了所謂的“上三旗”。

第二步，將鑲白旗，也就是原屬於正藍旗豪格的佐領，交給了給了自己的侄子，豪格的兒子富綬。

第三步，順治因怒遷恨，對多爾袞的親哥哥阿濟格下了死手。把他奪爵治罪，他所屬的佐領分別撥入了正白、鑲白、正藍三旗。

自此也就有了上三旗和下五旗的說法。其中上三旗由皇帝直接統領，下五旗由豪格、濟爾哈朗、代善、阿巴泰、多鐸、褚英等人的後裔統領。

具體來說：

正黃旗、鑲黃旗、正白旗——皇帝統領；

鑲白旗——豪格後裔統領。豪格是努爾哈赤之孫，皇太極長子；

正紅旗——代善後裔統領。代善是努爾哈赤的次子；

鑲紅旗——嶽託、碩塞、褚英後裔統領。其中嶽託是代善的兒子，努爾哈赤之孫；碩塞是皇太極的兒子，努爾哈赤之孫；褚英是努爾哈赤的長子，代善和皇太極的大哥。

正藍旗——阿巴泰、多鐸後裔統領。阿巴泰是努爾哈赤的第七子，皇太極的哥哥；多鐸是努爾哈赤的嫡幼子，皇太極的弟弟。

鑲藍旗——濟爾哈朗後裔統領。濟爾哈朗是舒爾哈齊的第六子，努爾哈赤的侄子，皇太極的堂弟。

康熙繼位後，為了進一步的削弱諸王對下五旗的掌控。他大力推行了皇太極時期開創的都統制度，讓都統取代旗主。因為都統是朝廷委派的流動官員，沒有世襲權利。於是原本屬於各旗旗主的旗權，在康熙時期就基本讓都統給奪去了。（都統可以讓非宗室的人擔任，屬於從一品）

然後，康熙又將皇子分封到下五旗，去下五旗做小旗主，繼續分化下五旗。比如雍正就當過鑲白旗的小旗主。雍正繼位之後，他兒子洪晝還當過正藍旗的大旗主。此政策一直延續到了道光皇帝時期，才算是把八旗完全控制在了皇帝的手中。

總結：清初時期，旗主對本旗的影響力是非常大的。為了鞏固皇權，從皇太極開始，清代皇帝就開始分化旗主們的旗權。在乾隆皇帝的中晚期，旗主已經名存實亡。到了道光時期，已經沒有所謂的旗主了。

至於什麼人才能擔任旗主，一句話可以對這個問題進行總結——只有努爾哈赤和舒爾哈齊的後裔才能擔任旗主。這兩群人全部都是擁有系黃帶子特權的皇室宗親。